本书共收基础微生物学、应用微生物学和微生物学实验方法等分科名词、名称近5000条。其中除十分注重基础微生物学和分子微生物学内容外，还对各大类微生物的新分类体系及其代表性的科、属、种等作了重点介绍；对现代应用微生物学各分支，包括医学微生物学、免疫学、植物病理学、工业微生物学等学科，都选用了一定数量的重要条目；为便于微生物学实验工作人员参考，书中较详细的介绍了各种重要的实验方法、试剂、培养基、仪器和有关装备；为满足教学工作者了解微生物学史的特殊需要，专门编写了160余位古今中外为发展微生物学曾做出重大贡献的著名微生物学家条目等。